Вода, применяемая в исследовательских целях, должна быть химически чистой (без примесей, солей, бактерий) во избежание искажение данных экспериментов.
В химически очищенной воде содержание солей и примесей влияет на ее проводимость, согласно ГОСТ 6709-72(2005) она менее 5 мкСм. Именно электрическая проводимость лежит в основе классификации очищенной химической воды. Согласно стандарту ASTM 1193-99 различают 4 типа воды (таблица 1), проводимость которой изменяется от 5 до 0,056 мкСм; чем чище вода, тем меньше в ней содержания натрия, хлора и кремния. Кроме того, нормируется содержание бактериальной микрофлоры (таблица 2).

Наиболее распространенным способом приготовления чистой воды является дистилляция (перегонка). При однократном испарении в дистилляторах чистая вода отводится виде паров с последующей их конденсацией. При повторном испарении дистиллята и конденсации паров получают более чистую воду - бидистиллят. Согласно стандарту ASTM D1193 эта вода будет соответствовать типу II, II и IV.

Для повышения чистоты воды дистиллят дополнительно пропускают через фильтр (например, согласно ASTM для воды типа III необходим фильтр с размерами пор 0,45 мкм). Также для очистки используют адсорбцию и электрические методы (диализ, обратный осмос). Если этими методами подготовить воду до дистилляции, то полученная вода будет еще более высокой чистоты.

К химически чистой воде наиболее близка деионизованная вода, получаемая фильтрацией через ионообменные смолы. Эта вода в идеале не содержит посторонних ионов кроме Н₃О⁺ и ОН^-, но может содержать микрофлору (бактерии).
Очищенную воду I, II и III типов необходимо хранить в герметично закрытой таре во избежание поглощения из воздуха газов, микроорганизмов и пр.